C'est exactement ce que j'ai mis!
for (var i=0; i<document.modif["fichier[]"].length; i++) {
if (document.modif["fichier"][i].value != "") {
document.modif["img"][i].value = "oui";
}
else {
document.modif["img"][i].value = "non";
}
}
...
...
<input type="file" name="fichier" size="1">
<input type="hidden" name="img" value="">
...
...
<input type="file" name="fichier" size="1">
<input type="hidden" name="img" value="">
...
...
<input type="file" name="fichier" size="1">
<input type="hidden" name="img" value="">
etc
J'ai pas de soucis en php

Juste en js :/, je voudrais jsute avoir fichier1, img1, fichier2, img2...